Совершенствование алгоритмов численного моделирования в методе динамики частиц — различия между версиями
(→Модифицированный метод Рунге-Кутты) |
(→Построение модифицированного метода Рунге-Кутты 4 порядка) |
||
Строка 29: | Строка 29: | ||
Идея заключается в разложении функций <math> f(x_n+k_i/2,t_n+Δt/2) </math> в ряд Тейлора в окрестности точки <math> (x_n,t_n) </math>. | Идея заключается в разложении функций <math> f(x_n+k_i/2,t_n+Δt/2) </math> в ряд Тейлора в окрестности точки <math> (x_n,t_n) </math>. | ||
− | <math> f(x_n+k_i/2,t_n+Δt/2)= \frac {\partial f} {\partial x} (x_n,t_n )∙k_i/2+ \frac {\partial f} {\partial t} (x_n,t_n ) Δt/2 + ... | + | <math> f(x_n+k_i/2,t_n+Δt/2)= \frac {\partial f} {\partial x} (x_n,t_n )∙k_i/2+ \frac {\partial f} {\partial t} (x_n,t_n ) Δt/2 + ... \ \ (3) </math> |
Здесь присутствуют малоприятные производные, однако, как потом окажется, с ними можно будет легко разобраться. Сколько членов в разложении нужно оставить, чтобы в схеме сохранился четвёртый порядок? – До <math> (Δt)^4 </math> и <math> (k_i )^4 </math> или меньше? | Здесь присутствуют малоприятные производные, однако, как потом окажется, с ними можно будет легко разобраться. Сколько членов в разложении нужно оставить, чтобы в схеме сохранился четвёртый порядок? – До <math> (Δt)^4 </math> и <math> (k_i )^4 </math> или меньше? | ||
Строка 37: | Строка 37: | ||
В случае, когда правая часть (1) не зависит явно от времени, (3) предельно упрощается. | В случае, когда правая часть (1) не зависит явно от времени, (3) предельно упрощается. | ||
− | <math> f(x_n+k_i/2,t_n+Δt/2)=∂f/∂x (x_n,t_n )∙k_i/2 | + | <math> f(x_n+k_i/2,t_n+Δt/2)=∂f/∂x (x_n,t_n )∙k_i/2 \ \ (4) </math> |
Данная ситуация имеет место при молекулярно-динамическом моделировании, поскольку потенциал взаимодействия, как правило, является функцией только координат и скоростей частиц. | Данная ситуация имеет место при молекулярно-динамическом моделировании, поскольку потенциал взаимодействия, как правило, является функцией только координат и скоростей частиц. | ||
Строка 47: | Строка 47: | ||
<math> f(x_n+k_i/2,t_n+Δt/2) = (v,\frac{F(r+k_i^r/2)}{m}) = ( v+\frac {k_1^v}{2},\frac {F(r+\frac {k_1^r}{2})}{m} )= </math> | <math> f(x_n+k_i/2,t_n+Δt/2) = (v,\frac{F(r+k_i^r/2)}{m}) = ( v+\frac {k_1^v}{2},\frac {F(r+\frac {k_1^r}{2})}{m} )= </math> | ||
− | <math> =( v+\frac {k_1^v}{2},\frac {F_n + \frac {dF}{dr} (r) \frac{k_1^r}{2}}{m} ) | + | <math> =( v+\frac {k_1^v}{2},\frac {F_n + \frac {dF}{dr} (r) \frac{k_1^r}{2}}{m} ) \ \ (5) </math> |
где | где | ||
− | <math> \frac {dF}{dr} | + | <math> \frac {dF}{dr} = \frac {\Delta F}{\Delta r} = \frac {\Delta F}{\Delta r} \frac {\Delta t}{\Delta t} = \frac {\Delta F}{\Delta t} \frac {\Delta t}{\Delta r} =\frac {F_n - F_(n-1)}{\Delta t } \frac {1}{v} \ \ (6) </math> |
+ | |||
+ | С учётом вышесказанного, мы можем записать конечно-разностную схему Рунге-Кутта для молекулярно-динамического моделирования | ||
+ | |||
+ | <math>k_1^v=\Delta t \frac {F_n}{m}</math> | ||
+ | |||
+ | <math>k_2^v=\Delta t \frac {F_n}{m}+\frac{F_n-F_(n-1)}{2m}</math> | ||
+ | |||
+ | <math>k_3^v=\Delta t \frac {F_n}{m}+\frac{F_n-F_(n-1)}{2m}</math> | ||
+ | |||
+ | <math>k_4^v=\Delta t \frac {F_n}{m}+\frac{F_n-F_(n-1)}{m}</math> | ||
+ | |||
+ | <math>k_1^r=\Delta t \frac {F_n}{m}</math> | ||
+ | |||
+ | <math>k_2^r=\Delta tv_n+\frac {v_n-v_(n-1)}{2}=\Delta t \frac {v_n+(k_1^v}{2}</math> | ||
+ | |||
+ | <math>k_3^r=\Delta tv_n+\frac {v_n-v_(n-1)}{2}= \Delta t \frac {v_n+(k_2^v}{2})</math> | ||
+ | |||
+ | <math>k_4^r=\Delta tv_n+v_n-v_(n-1)= \Delta t(v_n+k_3^v )</math> | ||
+ | |||
+ | <math>r_(n+1)=r_n+1/6 (k_1^r+2k_2^r+2k_3^r+k_4^r )</math> | ||
+ | |||
+ | <math>v_(n+1)=v_n+1/6 (k_1^((v) )+2k_2^((v) )+2k_3^((v) )+k_4^((v) ) ) \ \ (8) </math> | ||
+ | |||
+ | Выражения для <math> k_i^r</math> представлены в двух видах: один – с учётом рассмотренного упрощения, а второй - классический Рунге-Куттовский, который применим для уравнения по <math> r </math> ввиду простой правой части. | ||
== Обезразмеривание системы как способ уменьшения накопления вычислительной ошибки == | == Обезразмеривание системы как способ уменьшения накопления вычислительной ошибки == |
Версия 16:38, 16 октября 2011
Содержание
Задача
- ...
Построение модифицированного метода Рунге-Кутты 4 порядка
Рассмотрим задачу Коши
Для неизвестной вектор-функции x(t), в качестве которой для примера может быть взят вектор
координат позиции и скорости тела. Данная задача может быть решена численно классическим методом Рунге-Кутты четвёртого порядка.
По сравнению с методами Эйлера, Лагранжа и Верле, данный метод имеет более высокий порядок точности. Однако классический метод Рунге-Кутты четвёртого порядка имеет одну особенность, связанную с необходимостью вычислять функцию
четыре раза за одну временную итерацию. Потому этот метод становится неэффективным в вычислительных задачах, где основное расчётное время тратится на вычисление правой части системы дифференциальных уравнений, как, например, это имеет место в случае расчёта молекулярно-динамической задачи множества частиц. Вследствие данной особенности применение метода Рунге-Кутты становится неэффективным и даже его исключительная точность теряет свою значимость.Ниже приводится модификация метода Рунге-Кутты 4 порядка, где с помощью одного хитрого приёма удаётся избежать многократного вычисления функцию
на одном временном шаге и в то же время сохранить высокий порядок по времени.Идея заключается в разложении функций
в ряд Тейлора в окрестности точки .
Здесь присутствуют малоприятные производные, однако, как потом окажется, с ними можно будет легко разобраться. Сколько членов в разложении нужно оставить, чтобы в схеме сохранился четвёртый порядок? – До
и или меньше?Для слагаемых с локальными производными по времени ответ очевиден – необходимо удерживать всё вплоть до
, ибо в противном случае мы потеряем наш 4-й порядок по времени для схемы в целом. Однако для на самом деле достаточно только первой производной.В случае, когда правая часть (1) не зависит явно от времени, (3) предельно упрощается.
Данная ситуация имеет место при молекулярно-динамическом моделировании, поскольку потенциал взаимодействия, как правило, является функцией только координат и скоростей частиц.
Запишем (4) в случае молекулярно-динамического моделирования. В нашем случае неизвестная вектор-функция
.
где
С учётом вышесказанного, мы можем записать конечно-разностную схему Рунге-Кутта для молекулярно-динамического моделирования
Выражения для
представлены в двух видах: один – с учётом рассмотренного упрощения, а второй - классический Рунге-Куттовский, который применим для уравнения по ввиду простой правой части.Обезразмеривание системы как способ уменьшения накопления вычислительной ошибки
- ...
Frozen Particles & Press Particles
- ...